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Table 2 Amino acid residues in conserved motifs of Kolobok transposase

From: Multiple massive domestication and recent amplification of Kolobok superfamily transposons in the clawed frog Xenopus

Name

DDE

H2CH

C2CH

PWF

AVPTIF

Conservation

Tr1

DDE

HHCH

CCCH

PWF

SIPTQF

 

Tr2

DDE

HHCH

YCCH

PWF

AIPSVF

 

Tr3

DGD

HHCH

--CP

PLL

ALQ-LM

 

Tr4

DNK

HHCQ

CCCH

PWF

ATPTLF

 

Tr5

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr6

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr7

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr8

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr9

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr10

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr11

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr12

DDE

HHCH

CCCH

PWF

ATPTSF

 

Tr13

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTLF

+

Tr14

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTLF

+

Tr15

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTLF

+

Tr16

DDK

HHCH

CCCH

PWF

AIPTIF

 

Tr17

DED

HHCH

CCCH

PWF

AVPTQF

 

Tr18

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTVF

+

Tr19

DGE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr20

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr21

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTLF

+

Tr22

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTLF

+

Tr23

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTLF

+

Tr24

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr25

DDE

HHCH

-VCH

PWF

AVPTIF

 

Tr26

DDV

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr27

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AMPTQF

 

Tr28

GDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr29

GNE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr30

DDL

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr31

DDL

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Tr32

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Tr33

NDT

HDCN

CCCH

PWF

ALPTIF

 

Tr34

DEE

HHCH

--T-

P--

TEPVVV

 

Tr35

DDE

HHCH

S-C-

P--

 

Tr36

DD-

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIY

 

Tr37

DDE

YHCH

-SC-

S-F

---T--

 

Tr38

DED

HHCH

Y-CK

--L

SLSTLL

 

Lv1

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPSIF

+

Lv2

DED

HHCH

CCCH

PWF

AVPTLF

 

Lv3

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPSIF

+

Lv4

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTIF

+

Lv5

DDK

HHCH

CCCH

PWF

AFPTLF

 

Lv6

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Lv7

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Lv8

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

++

Lv9

DNK

RHCH

CCCH

PWF

ATPTLF

 

Lv10

HDN

HHCH

CCCH

PWF

AIPTIF

 

Lv11

DDQ

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv12

YNE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv13

DDK

HNCH

CCCH

PWF

ALPSIF

 

Lv14

GDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv15

DEE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTIF

 

Lv16

DSE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv17

DDQ

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv18

DDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTVF

+

Lv19

DDL

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv20

GDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv21

GDE

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 

Lv22

GDE

HHCH

CCCH

PWF

AIPTIF

 

Lv23

DDP

HHCH

CCCH

PWF

AVPTLF

 

Lv24

DDK

HHCH

CCCH

PWF

AVPTIF

 
  1. The “++” in the “Conservation” column indicates that all motifs are conserved. The “+” in the same column indicates that all motifs are conserved except for substitutions of similar amino acids in the AVPTIF motif